半枫荷叶片转录组特征研究

摘要

半枫荷为特色木本药用植物,药用历史悠久,具有活血通络、祛风除湿、止血化瘀等功效.为探索半枫荷活性成分生物合成的分子基础,本文通过 Illumina HiSeq 4000 高通量测序技术对半枫荷叶片开展转录组测序分析,共获得了 112 361 条 Contigs,进一步组装得到 93 602 条 unigenes.对半枫荷叶片转录组 unigenes 进行 Blast 分析,得到 47 798 个 CDS 片段;与 Swiss-Prot 数据库相比较,得到 29 778 个蛋白同源序列;与 COG 数据库比对,有 19 279 条 unigenes 被 COG 功能注释;进行 GO 功能分类分析,有 29 330 条 unigene 注释到 GO 数据库中;进行 KEGG 功能注释,发现 16 621 个 unigenes 参与了 131 条代谢通路;通过生物信息学分析,发现多个萜类化合物生物合成途径关键基因.另外,转录组序列中共检测到 21 819 个 SSR 位点,其中二核苷酸所占比例最高,达到了47.93%.研究结果不仅为进一步挖掘半枫荷次生代谢产物合成途径的关键基因提供了丰富的基因资源,同时为半枫荷遗传多样性研究奠定了分子基础.