石刁柏Ty1-copia反转座子逆转录酶序列克隆及异质性分析

摘要

对石刁柏(Asparagus officinalis)品种UC309及TD818的两个反转座子逆转录酶序列进行了PCR扩增并对其在基因组中的异质性进行了分析.结果表明,s101366和s107518两个转座子序列均属于Ty1-copia反转座子,是Ty 1-copia反转座酶的部分保守区序列,其长度分别为636和653 bp.对随机获得的两个反转座子测序表明两个反转座子存在一定的异质性,其突变主要是由于发生了碱基置换,其中碱基转换分别占到80.4％和80.0％,T—C和G—A转换的比例差异不显著.通过对两个石刁柏品种(TD818和UC309)中获得的序列聚类分析发现,s101366和s107518均未表现出性别间、品种间及近缘种间的保守性,甚至表现出了种内异质性大于种间的异质性特征.这说明了两个反转座子处于高度变异的状态.是产生染色体不稳定的重要因素之一.