水稻CMS相关基因在稻属AA基因组中的分布及其单核苷酸多态性

摘要

水稻线粒体基因组嵌合基因orf79和orfH79分别被认为与BT-型和HL-型水稻CMS有关,两者具有98%的同源性,并且其DNA序列只存在4核苷酸的差异.对于这两个嵌合基因,前者来源于栽培稻(Oryza.sativa L.),而后者则来源于普通野生稻(O.rufipogonGriff.).这意味着orf79/orfH79可能在广泛分布于稻属AA基因组中.为了调查orf79/orfH79在稻属物种中的分布和变异,190份栽培稻品系[包括156份亚洲栽培稻(O.sativa var.1andrace)和34份非洲栽培稻(O.glaberrima)]以及104份稻属AA基因组野生稻品系(包括O.rufipogon、O.nivara、O.glumaepatula、O.barthii、O.longistaminata和O.meridionalis 6个种),被用于PCR扩增检测.31份具有控制粤泰A和笹锦A的特异片段的稻属AA基因组水稻品系被检测出.所有特异片段均被回收并测序,基于DNA序列的聚类结果显示31份水稻材料被分成了两组,分别代表为BT-型和HL-型水稻不育细胞质组群.结果也进一步表明:HL-型水稻CMS胞质主要分布于一年生的O.nivara中;BT-型水稻CMS胞质可能来源于裁培稻变种或多年生野生稻O.rufipogon.