褶纹冠蚌线粒体基因组全序列分析

摘要

采用LA-PCR(Long amplification polymerase chain reaction)扩增方法首次获得褶纹冠蚌(Cristaria plicata)线粒体基因组全序列.分析表明:序列全长15712 bp,包括13个蛋白质基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和26个长度为2～328 bp的非编码区.A、T、C、G碱基组成分别为36.54%、27.22%、23.22%、13.02%.大部分基因在L链编码,其中ND3-ND5、ND4L、COⅠ～COⅢ、ATP6、ATP8、tRNA~(Asp)和tRNA~(His)在H链编码.基因排列与同科的射线佩饰真珠蚌(Lampsilis ornam)一致,与三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)在COⅡ和12S rRNA之间存在差异.13个蛋白质基因具有I(AUU,AUC)、V(GUG)、M(AUA、AUG)3种起始密码子,除ND2终止密码子为不完整的T,其余基因均为典型的UAA或UAG.22个tRNA中,除tRNA~(Thr)、tRNA~(Lys)、tRNA~(Ser)(UCN)、tRNA~(Asp)、tRNA~(Arg)、tRNA~(Tyr)和tRNA~(Met)之外,其他15个tRNA都具有典型三叶草结构.与其他淡水双壳贝类一样,褶纹冠蚌具有ATP8基因,该基因可能与细胞质的渗透压平衡有关.