基于SLAF-Super BSA技术的玉米萌发期耐冷性定位的初步研究

摘要

为加快玉米萌发期耐冷性遗传育种研究,在对玉米重组自交系群体进行萌发期耐冷性鉴定的基础上,采用分离群体混合分析(Bulked Segregant Analysis,BSA)方法,对2亲本和2混池进行特异位点扩增片段测序(Specific-locus Amplified Fragment-sequencing,SLAF),初步定位了玉米萌发期耐冷性相关的染色体区段,并对关联区域内的基因进行初步富集分析.结果表明:研究获得了282563个SLAF标签,每个SLAF标签平均父本测序深度为27.06×,母本平均测序深度为31.85×,耐冷池和冷敏感池的测序深度分别为36.72×和34.17×.获得多态性SLAF标签47624个,多态性比例为16.85％.通过BSA关联分析在玉米第9号染色体上定位到了一个91.06 Mb大小的玉米萌发期耐冷性关联区域,区域内共关联到3170个基因.