核桃响应低温胁迫转录因子ICE1基因的克隆与分析

摘要

为分析ICE(Inducer of CBF Expression)基因在核桃响应低温胁迫中的结构与功能,对低温胁迫下的核桃枝条进行转录组测序并利用RT-PCR技术分析并克隆得到核桃(Juglans regia L.)中ICE同源基因,并进一步对其进行生物信息分析及转录表达分析.结果 表明,JrICE1(Genbank:109001301) CDS序列全长为1659 bp,最大开放阅读框1659 bp,编码552个氨基酸;JrICE1为不稳定亲水性蛋白,理论等电点5.73.同源比对发现ICE蛋白和其他植物一样具有bHLH基因家族的典型功能区域,包括富S区、NLS区、bHLH结构域,类泛素化(SUMO)结合位点各1个,且在bHLH结构域高度保守,核桃JrICE1与毛果杨(Populus trichocarpa)、甜杨(Populus suaveolens)关系最近.利用转录组分析ICE1在"辽宁8号"(耐低温)和"清香"(不耐低温)低温胁迫48 h后中的表达模式表明,JrICE1在"辽宁8号"和"清香"叶片中表达均显著上升0.53倍和4.5倍.