大赤隐翅虫的线粒体基因组研究及系统发育分析

摘要

【目的】探究大赤隐翅虫Philonthus spinipes(Sharp,1874)的线粒体基因组结构特征及隐翅虫亚科的系统发育关系。【方法】利用高通量测序技术获得大赤隐翅虫线粒体基因组的全序列。在系统发育分析中,选择隐翅虫亚科的21个物种和毒隐翅虫亚科的8个物种作为内群,并选择2个蚁甲亚科Pselaphinae的物种作为外群,利用最大似然法和贝叶斯法重建隐翅虫亚科的系统发育关系。【结果】大赤隐翅虫的线粒体基因组包含37个基因(13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因)和一段非编码控制区。整个线粒体基因组全长为16219 bp(GenBank登录号:OL998729)。大赤隐翅虫线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的起始密码子除nad6和nad1利用ATC和TTG开头外,其余蛋白质编码基因都是以ATT、ATA和ATG开头。4个蛋白质编码基因(cox1、cox2、cox3和nad5)以不完整的终止密码子T或TA结尾,其余9个蛋白质编码基因以完整的终止密码子TAA或TAG结尾。除trnS1因缺少DHU臂而形成一个简单的环,无法形成稳定的三叶草结构外,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。rrnL基因的全长为1275 bp,A+T含量为79.84%。rrnS基因全长为765 bp,A+T含量为76.47%。【结论】两种不同的系统发育分析方法构建的隐翅虫亚科的系统发育关系是基本一致的,均表明隐翅虫亚科为非单系群;毒隐翅虫亚科为单系群;毒隐翅虫亚科嵌套在隐翅虫亚科中。