花脸香蘑菌株ITS序列分析及二级结构预测

摘要

以云南地区2个野生香蘑属真菌子实体（H和Z2）为试验材料,结合GenBank中数据,开展ITS序列研究,探讨该序列作为香蘑属真菌系统发育研究的可行性及传统分类与分子系统发育分析的异同。用PCR方法扩增了2个供试样品的rDNA ITS （含5.8S）序列并测序,与GenBank中已提交的香蘑属菌株的ITS序列进行比较,分析了云南不同地区2个供试样品ITS序列的一级结构与其RNA二级结构的变异规律。去除两端未对齐的区域后,2个样品与GeneBank中8条同源序列的ITS比对长度为632 bp,（G+C）含量41.40%～41.70%,有14个变异位点,13个信息位点。结合NJ系统发育树与传统的形态分类结果,将2个样品鉴定为花脸香蘑（Lepista sordida）。综上,花脸香蘑遗传多样性与地理来源没有显著相关性,但Z2 （云南）、 MN258660 （江西）、MG516585 （山东）等3个花脸香蘑菌株与其他菌株的ITS序列在种内存在一定的遗传差异,这种遗传分化可能是由于自身遗传体系与产地复杂变化的自然生态环境长期共同作用形成。ITS区RNA二级结构在花脸香蘑种内基本相同,具有较强的保守性,而在香蘑属种间差异显著。结果表明,rDNA ITS区一级、二级结构分析结果与传统的形态分类结果基本一致,基于ITS序列构建的NJ发育树和RNA二级结构均可确定花脸香蘑及其近缘物种的种属归类,并且可为香蘑属不同物种间的准确区分提供重要的分子依据。