新疆天然胡杨林地区根际微生物的种群分析

摘要

在新疆塔里木河流域的现存世界上面积最大的天然胡杨林采集了根际土壤样品,共分离纯化得到140个菌株,并真空冷冻干燥保存于中国典型培养物保藏中心.随机选取其中53株细菌的基因组进行16S rDNA测序,并通过NCBI进行比对来初步鉴定.以16S rRNA基因相似性低于97％时作为不同的分类单元定义,这些菌株可以划分为47个不同的分类单元.系统发育树将这些菌株聚类于厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和疣微菌门等5个门.其中优势种群为变形菌门(Proteobacteria)细菌.分离菌株中潜在的新分类单元(相似性＜97％)所占比例较高,约占分离总数的26.4％.其中,菌株R37与T44相关的多相分类数据已经发表于国际系统与进化微生物学杂志上,分别代表了一个新属(Parasegetibacter luojiensis gen.nov.,sp.nov.)与一个新种(Niastellapopuli sp.nov.).该研究一方面对胡杨林根际土壤可培养微生物进行了种群分析,了解了其微生物群落的多样性;另一方面获得了大量新的菌种资源,为进一步的开发利用提供条件.