浙江省啮齿动物携带心病毒的遗传特征研究

摘要

目的 了解我国浙江省的啮齿动物携带心病毒情况,并分析其遗传特征.方法 用反转录-聚合酶链反应选啮齿动物粪便标本中的心病毒,扩增其全基因组;利用Lasergene软件分别对多聚蛋白、P1蛋白、2C+ 3CD蛋白序列与GenBank下载的序列进行同源性分析;分析其基因组与多聚蛋白的特征;利用PhyML软件构建系统发生树.结果 浙江省啮齿动物携带心病毒.毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3的多聚蛋白、P1以及2C+ 3CD蛋白与心病毒B的同源性分别为71.9％ ～ 85.4％、65.2％ ～89.8％与78.3％ ～ 95.4％,属于心病毒B;毒株Wencheng-Rn416的多聚蛋白、P1以及2C +3CD蛋白与Boone心病毒的同源性分别为92.5％ 、85.3％与96.9％,属于心病毒C.系统发生分析也表明毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3与心病毒B的亲缘关系最近,Wencheng-Rn416与Boone心病毒的亲缘关系最近.系统发育分析发现啮齿动物在心病毒的起源与进化过程中起着重要的作用,并且可能发生跨种间传播而感染人.结论 我国浙江省啮齿动物携带心病毒,并可能跨种间传播到人.