广东省东莞市1株麻疹野病毒核蛋白基因分析

摘要

目的 分析2008年广东省东莞市疫情中分离到的1株麻疹病毒的核蛋白基因序列,了解毒株基因型别及其核蛋白基因变异情况.方法 采集麻疹疫情中病例的尿液标本,用VERO-SLAM细胞进行病毒分离培养,对分离到的病毒株通过反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增麻疹病毒核蛋白基因片段,对扩增产物进行测序并与麻疹各基因型代表株及沪191疫苗株进行序列比对和构建进化树分析.结果 分离到的麻疹病毒株属于H1基因型H1a亚型.与China93-2毒株同源性最高,为99.1%,与China94-7毒株同源性为97.1%,与其他几株H1亚型的同源性则在97.6%～98.0%之间.与沪191疫苗株同源性为92.9%.结论 此次疫情中的毒株属于H1基因型H1a亚型,与中国其他地区的流行情况一致.与其同亚型的毒株相比变异较小.