38例临床患者留置导尿管的微生物群落多样性分析

摘要

目的通过研究患者导尿管样品中微生物群落构成,探索感染相关的潜在风险因素。方法收集2020年11~12月期间西苑医院38例患者留置的导尿管。提取样品中的细菌总DNA,PCR扩增16S rRNA V4-V5区。利用Hiseq 2500测序平台进行测序,数据使用skewer、FLASH等软件进行细菌群落结构及多样性分析。结果38例患者平均年龄为(82.1±7.2)岁,导尿管平均留置时间为(25.50±9.66)d。有效序列1603007条,有效序列长度在382bp至442bp之间,共得到11350个OTUs和1,668,076个优质序列。S1-S5时间段分组,各组样品中革兰氏阴性菌所占比例均高于阳性菌,36个样品存在含量>50%的优势菌门,占全部样品的86.8%。结论导尿管为相对封闭环境,微生物群落具有特定性,导尿管中菌群变化规律总体上与留置时间相关,长留置时间可能导致高度单一菌群结构出现。