侵染安徽玉米的水稻黑条矮缩病毒全基因组特征

摘要

[目的]测定水稻黑条矮缩病毒（Rice black-streaked dwarf virus,RBSDV）安徽分离物全基因组序列,分析RBSDV安徽分离物与RBSDV其他分离物以及斐济病毒属（Fijivirus）其他成员之间的分子差异,为明确RBSDV遗传变异与进化规律提供重要信息.[方法]采用RT-PCR法从安徽玉米粗缩病样本中扩增RBSDV的全基因组,克隆、测序并进行序列分析.[结果]获得RBSDV安徽分离物全基因组序列.序列比对发现,RBSDV安徽分离物与其他RBSDV各个分离物S1到S10的序列相似性较高,为87.6%-99.5%,其中与RBSDV韩国分离物（RBSDV-KOR）序列相似性最高,达94.6%-99.5%;从构建的系统关系树也可以看出,RBSDV安徽分离物和其他所有RBSDV分离物均聚成一个单独的分支.[结论]RBSDV各分离物之间亲缘关系很近.RBSDV安徽分离物与RBSDV-KOR亲缘关系最近,可能起源于相同的祖先.另外,推测RBSDV各个基因组片段可能是协同进化的.