肠道病毒核苷酸序列和血清型的相关性

摘要

目的了解肠道病毒VP1区、VP4-VP2区核苷酸序列与血清型的相关性。方法逆转录-多聚酶链反应（RT-PCR）和核苷酸测序后,病毒分离物与肠道病毒原型株部分VP1区、VP4-VP2区的核苷酸和氨基酸一致性比较、亲缘关系树分析及血清中和实验。结果与同源原型株比较,16株病毒分离物VP1区核苷酸一致性为78%-85%,氨基酸一致性为90%-99%;VP4-VP2区核苷酸一致性为77%-86%,氨基酸一致性为96%-99%。VP1区核苷酸亲缘关系树分析显示同源血清型聚集在同一进化分支上（bootstrap值90%-99%）。15株分离物的VP4-VP2区血清型与VP1区血清型一致。14株分离物的血清型用经典中和实验得到证实。结论VP1区核苷酸序列同病毒血清型相关联。