石油降解菌株G516SrDNA全序列的系统学分析

摘要

用PCR方法扩增了一株石油降解菌株G5的 16SrRNA基因全序列 ,并对其进行了克隆和测序 .对该序列在GenBank中的BLAST结果表明 ,所有与该序列高度同源的序列都是假单胞菌的 16SrRNA基因 .其中假单胞菌的代表菌株Pseudomonasaeruginosa,P .fluoroscens,P .putida ,P .syringae的 16SrRNA基因序列与G5的 16SrRNA基因序列同源性分别为 93.4 % ,98.4 % ,96 .3% ,97.5 % .对G5和其他 39株假单胞菌的 16SrRNA基因序列进行聚类分析 ,获得的系统发育树与RDP(RibosomalDatabaseProject)报道的系统发育树基本一致 ,其中菌株G5与 5株P .chlororaphis聚类在一起 .图 2参