APC和CDKN2A基因甲基化定量分析对肝细胞癌的诊断价值

摘要

目的:系统分析基因甲基化在肝癌发生中涉及的分子途径,从中选取代表性基因进一步分析其甲基化在细胞癌变过程中的生物学及临床意义.方法:对10年间关于肝癌基因甲基化相关文献进行数据发掘与功能分类,在其中2个与肝癌发生相关的生物途径中选取APC和CDKN2A基因,采用实时定量甲基化特异性PCR技术对46例成对肝癌与癌旁组织中基因的甲基化水平进行定量分析并评估其诊断价值.结果:生物信息学分析显示肝癌中发生甲基化的基因主要涉及Wnt/β-catenin、p16及p533个主要分子途径;甲基化分析表明CDKN2A基因在肝癌组织中甲基化水平极显著高于癌旁组织(P<0.0001),并且癌组织中甲基化程度在高龄患者中较高(P=0.0027);ROC曲线分析表明通过CDKN2A甲基化定量分析能够高效区分癌与非癌组织(AUC=0.8526).APC基因在癌与癌旁间总体甲基化水平无显著性差异(P=0.0656).结论:CDKN2A基因甲基化水平的升高在肝细胞癌变过程中可能具有重要作用,其甲基化水平的升高可作为一种鉴别癌与非癌组织的分子标志物.CDKN2A甲基化模式的特异性使其在肝癌早期筛查和诊断中具有一定的临床应用价值.