受盐胁迫诱导表达的旱地棉GarMSL基因结构与表达特征

摘要

棉属野生旱地棉种具有很好的耐盐性,是开展棉花耐盐性机制研究以及改良陆地棉耐盐性的重要资源。基于cDNAAFLP技术分离获得了旱地棉盐胁迫下的差异表达片段序列信息,利用电子克隆方法并在基因组和转录水平上进行全长基因验证,克隆获得1个编码旱地棉类机械敏感离子通道蛋白的基因,命名为GarMSL(GenBank登录号:KC167359)。该基因ORF长为2 124 bp,编码707个氨基酸,含13个外显子和12个内含子。生物信息学分析显示,该蛋白包含ABC转运体功能域、阳离子外排功能域及机械敏感离子通道功能域等多种蛋白功能域。拷贝数分析推测,该基因在二倍体棉种基因组中含1个拷贝,在四倍体棉种基因组中含2个拷贝。qRT-PCR分析显示,该基因在旱地棉不同盐处理时期的叶片和根中均上调表达,在诱导24 h后表达水平达到高峰。