广东割手密SSR遗传多样性分析

摘要

割手密是甘蔗近缘野生种之一，在甘蔗育种中具有重要地位和作用。本研究采用Genomic-SSR和EST—SSR两种类型分子标记对来自广东各个地区的67个割手密种质进行分析。在20对SSR引物上共检测到341个多态性条带，每个引物上的平均多态性为17．05，其中11个Genomic-SSR的平均多态性为20．82，9个EST-SSR的平均多态性为12．44。广东割手密在Genomic—SSR上的多态性显著高于EST-SSR上的多态性。Mantel Test分析表明：通过Genomic-SSR、EST—SSR以及Genomic-SSR＋EST-SSR三种方法所计算的试验材料的遗传距离矩阵之间都呈极显著相关（p〈0．01），说明应用两种类型SSR获得的各个材料间的遗传关系具有较高的一致性。广东割手密在20对SSR引物上的遗传多样性指数介于0．1064～0．2916之间，平均多样性指数为0．1943；各个材料间的遗传距离为0．0063-0．3082之间，平均为0．1935。UPGMA聚类分析表明：广东割手密之间的遗传关系和地理来源存在一定的相关，由南向北存在较为显著的地理分化。