一个新型湖羊瘤胃木聚糖酶基因的克隆和鉴定

摘要

构建了一个湖羊瘤胃未培养微生物的Fosmid宏基因组文库,获得了12,000个克隆,文库外源DNA总容量为3.6×108 bp,筛选得到2个表达内切-1,4-β-木聚糖酶活性的克隆,并对其中的一个克隆UMXYL2进行亚克隆。结果表明存在一个完整的全长为1086 bp的ORF,编码一个可能的内切-1,4-β-木聚糖酶基因UMXYL2-1-1(accession No.FJ814702)。Blastp分析得知UMXYL2-1-1的编码产物与产琥珀酸丝状杆菌Fibrobacter succinogenes(accession No.AAA21848.1)的内切-1,4-β-木聚糖酶同源性最高,氨基酸序列相似性为67%,属于糖基水解酶家族11的成员。遗传进化分析表明UMXYL2-1-1基因可能是来自湖羊瘤胃微生物丝状杆菌属一个未培养的种。