超抗原SED空间结构的同源建模及其免疫识别位点的预测

摘要

目的　对金黄色葡萄球菌肠毒素口 (SED)的空间结构和免疫识别位点进行预测。方法　运用同源建模的方法构建了SED的三维空间结构模型 ,比较SED与其它金黄色葡萄球菌肠毒素超抗原的氨基酸序列、二级结构和空间结构的差异 ,对可能的活性位点进行预测。结果　SED的空间结构与其它肠毒素超抗原相似 ,具有两个结构域 :氨基末端结构域和羧基末端结构域。α 螺旋和 β 折叠可能与维持SED超抗原的空间结构以及与MHC的结合有关 ,而环状区域更多的参与SED与TCR的相互作用。结论　结合已有的研究结果 ,最终确定SED的N2 3、F45、L5 9、N61、I92和F2 0