犬瘟热病毒野毒株融合蛋白主要功能区基因的变异研究

摘要

根据犬瘟热病毒（ＣＤＶ）融合蛋白（Ｆ）基因的核苷酸序列，设计合成了１０条引物。用１对引物从延吉犬病料中扩增出了含Ｆ２区基因的３１４ｂｐ的片段，除两端引物序列外为２６５ｂｐ，编码８８个氨基酸。它与日本弱毒株（ＣＤＶ－Ｊ）、Ｏｎｄｅｒｓｔｅｐｏｏｒｔ弱毒株（ＣＤＶ－ＯＮ）、海豹瘟热病毒２型（ＰＤＶ２）、１型（ＰＤＶ１）在核苷酸和氨基酸水平上的同源性，分别为９８．１％和９５．５％、９６．２％和９３．２％、９４．３％和９３．２％、７７．４％和８７．５％。对５份来自不同地区的ＣＤＶ病料的融合区基因片段进行了扩增、克隆和序列分析，其中北京１号犬（ＣＤＶ－Ｂ１）、２号犬（ＣＤＶ－Ｂ２）、沈阳犬（ＣＤＶ－Ｓ）和长春犬（ＣＤＶ－Ｚ）的２８３ｂｐ片段完全相同，而与哈尔滨犬（ＣＤＶ－Ｈ）的该片段有３个核苷酸和２个氨基酸不同。在核苷酸和氨基酸水平，北京犬野毒株等与ＣＤＶ－Ｈ、ＣＤＶ－Ｊ、ＣＤＶ－ＯＮ、ＰＤＶ２、ＰＤＶ１的同源性分别为９８．９％和９７．９％、９７．９％和９５．８％、９６．５％和９７．９％、９３．３％和９８．９％、７７．０％和８４．２％。本研究揭示了ＣＤＶ的流行毒株和相关毒株在融合蛋白上的亲缘关系，进一步证实了ＰＤＶ２?