抗胃癌抗体重链可变区序列分析及空间结构模拟

摘要

目的:通过序列分析确定抗胃癌抗体重链可变区(V_H)的一级结构,并借助同源模建方法模拟其三级结构.方法:从抗人胃癌噬菌体抗体库中筛选出V_H基因,并进行序列测定、翻译和分析.利用计算机辅助蛋白质空间模拟技术,采用同源模建、力学优化合理模建V_H的三维空间结构.结果:序列比对分析表明获得的V_H序列符合鼠抗体可变区特征,通过Kabat分析确定了FR、CDR;合理搭建了抗体重链可变区的空间构象,并通过分子力学优化获得了稳定的三维结构.结论:所测得的V_H一级结构和构建的三维空间结构均有较高的可靠性,为进一步的生物学实验奠定了基础.