广州汉族人群D12S391和D11S554基因座序列变异

摘要

为研究高度变异的STR基因座核心序列结构 ,对广州汉族人群突变率较高的D12S391和D11S5 5 4基因座等位基因进行了序列分析。结果显示D12S391基因座核心序列结构为 (AGAT) 8～ 17(AGAC) 6～ 10 (AGAT) 0～ 1,其较小片段等位基因 (15～ 18)仅表现为第 1个重复单位 (AGAT)数目的变异 ,而较大片段等位基因 (19～ 2 7) ,可表现为第 2或第 3个重复单位数目的变异。发现有 4种新的等位基因 ,分别命名为 2 2″、2 3″、2 4 和 2 7。D11S5 5 4基因座核心序列结构更复杂 ,有 5种核心序列 ,其中 3种具有相同的基本结构 (AAAGG) (AAAG) 4 (AAAGG) 2～ 3 (AAAG) 13～ 19。其大片段等位基因(2 19～ 2 4 9)核心序列结构中 ,既有四核苷酸重复 ,还有五核苷酸重复 ,以及单个硷基的变异、硷基插入或缺失。两基因座均存在序列异质性。结果表明D12S391和D11S5 5 4基因座属复杂重复类型 ,为其准确分型增加了难度 ,首先需建立相应群体的等位基因分型标准物。