大黄鱼α-珠蛋白cDNA的克隆及其特性分析

摘要

采用3'末端快速扩增法,首次从大黄鱼中克隆到564bp的血红蛋白α亚基cDNA。该序列包含435bp的开放读码框和126bp的3'末端非编码区,编码144个氨基酸的多肽。计算其可能的相对分子质量为15 930D,等电点为9.27,推导的氨基酸序列与其它13种鱼及人血红蛋白α亚基进行同源性比较,其同源性在35.7%￣70.3%之间,它与同属真口鱼纲的草鱼、大西洋鲑鱼、金鱼、虹鳟、金枪鱼、电鳗等的同源性较高,而与肉鳍鱼纲的肺鱼及板鳃纲的鲨鱼的同源性较低,而且发现该序列在CD5(第48位)处插入了一个独特的甘氨酸残基,在近端与血红素结合的F8(第90位)的组氨酸高度保守。