耐药基因在斑马鱼肠道内水平转移产生接合子的种属分析

摘要

目的研究耐药基因在斑马鱼体内水平转移发生的场所及产生的接合子的种属。方法通过将双荧光标记供体菌(红色荧光基因标记在基因组上,绿色荧光基因标记在RK2质粒上)喂食给斑马鱼,待质粒与肠道固有菌群发生接合转移后,采用流式细胞分选和16S rDNA高通量测序技术将接合子分选出来并进行种类和丰度的分析。结果接合子主要分布在后肠和粪便中,肠道和粪便接合子中既包括可培养细菌也包括非可培养细菌,且后者占全部接合子的90.4%~97.2%。其中气单胞菌属丰度最高,占全部细菌的90%以上,是肠道固有菌群中发生接合转移频率最高、最容易获得RK2质粒的菌属。其它的接合子主要来自Proteobacteria,Firmicutes和Fusobacteria菌门(总共占大约5%)。结论斑马鱼后肠是耐药基因发生接合转移的主要场所;肠道中非可培养菌是接受耐药质粒的主要受体菌。