草鱼GSTR基因外显子1、外显子2的SNPs筛选及其与生长性状的关联分析

摘要

根据草鱼EST数据库中的rho型谷胱甘肽硫转移酶基因cDNA序列设计引物,扩增预计存在的SNP位点。采用PCR产物测序法和PCR-RFLP法,在珠江水系草鱼养殖群体中筛选到2个SNP位点,分别位于外显子1和外显子2上,为C-T突变,且属于同义突变,统计了多态位点在群体中的分布:C+129T位点CC型占0.69%,TC型占8.75%,TT型占80.56%;C+192T位点CC型占25.4%,TC型占48.6%,TT型占26.1%。利用一般线性模型将SNPs与草鱼6个生长性状进行关联分析,结果表明,C+129T位点TT型个体6个生长性状均值比TC型高(P>0.05);C+192T位点TT型个体体质量均值高于TC型和CC型个体(P<0.05)。双倍型关联分析表明D1型个体的体质量均值明显高于D3型和D6型(P<0.05),因而可以考虑将GSTR基因作为影响草鱼体质量等生长性状的候选基因,应用于草鱼分子辅助育种。