泛太平洋西岸地区部分H5N1亚型禽流感病毒毒株血凝素基因特性的研究

摘要

目的了解泛太平洋西岸各个国家H5N1亚型人禽流感病毒血凝素（HA）基因分子特征,寻求HA基因变异规律。方法从Genebank中下载泛太平洋西岸国家或地区（包括泰国、越南、香港、印度尼西亚、中国大陆、蒙古、俄罗斯）50株H5N1亚型高致病性流感病毒（HAPI）毒株血凝素基因序列,利用生物信息学软件DNASTAR5.0进行核酸同源性分析,用MEGA3.1进行核酸和氨基酸序列比对和进化树分析。结果50株高致病性H5N1亚型流感病毒毒株可以分成3个相对独立的进化簇。第1簇为泰国越南簇;第2簇为中国印尼北亚簇（包含中国、印度尼西亚、蒙古以及俄罗斯）;第3簇主要为1996~2001年期间分离的毒株,该簇毒株HA基因与Gs/Gdlike毒株核酸同源性更为接近,其基因亚型更多表现为Gs/Gdlike或其他基因亚型。HA基因分子特征分析表明在HA蛋白抗原性上,泰国越南分离株表现基本一致,而其他地域分离株存在表现各异,但也存在地域的一致性。结论泛太平洋西岸地区分离的H5N1亚型禽流感病毒血凝素蛋白在分子特征上表现出一定的地域特异性,在一定地域范围内保持一致性。