沼泽红假单胞菌偶氮还原酶相关基因的克隆及其生物信息学分析

摘要

脱色实验证明沼泽红假单胞菌 (Rhodopsedomonaspalustris)对偶氮染料有较强的降解能力 ,作者通过GenBank搜索 ,对所获得的所有偶氮还原酶基因在NCBI进行比对并设计引物 ,从沼泽红假单胞菌质粒中扩增获得了一条含 4 71bp完整开放阅读框架的序列。GenBank搜索表明该基因为未登录的新基因。通过互联网数据库及生物信息学分析工具进行初步分析表明 :该基因编码的蛋白是一种等电点为 9.6 5的不稳定蛋白 ,定位于细胞质 ;由α螺旋、延伸带和随机卷曲三种形式组成 ,具有蛋白激酶C磷酸化等多个位点 ,并具有一个强跨膜疏水区。