使用16S rDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌

摘要

目的:测试应用16S rDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌的适用性。方法:用16S rDNA基因的扩增引物,对从腹泻者、水产品和环境中分离获得的副溶血性弧菌(n=39)及临床分离的15种(n=181)常见菌的基因组DNA进行聚合酶链反应,产物经琼脂糖凝胶电泳纯化后直接测序。序列通过blastn,在GenBank中比对,确定细菌属种并与表型法结果进行比较。结果:220株菌(220/220)扩增出870 bp的目的片段,平均测序长度752 bp。36/39株副溶血性弧菌鉴定结果与生化培养法相符,3株菌株分别鉴定为科氏葡萄球菌(Staphylococcus cohnii),表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)和Oceanobacillus profundus。181株其它临床分离菌无误判为副溶血性弧菌,其中123株与生化培养法结果一致,58株有差异。结论:本文报告的16S rDNA基因序列分析可用于准确鉴定副溶血性弧菌,并可与15种临床常见分离菌区分。