EIN3/EIL基因家族的系统进化

摘要

为了研究37个物种中EIN3/EIL基因家族的系统进化,利用生物信息学手段从系统发育、基因结构、表达分析和共线性等方面对EIN3/EIL基因家族分析。在37个物种的基因组中共鉴定出203个EIN3/EIL家族基因。分析亚家族中选取的6个结构稳定且支持度高的,有51个EIN3/EIL基因在这6个亚家族中,其中约86%的基因无内含子,98%的EIN3/EIL等电点小于7,其蛋白氨基酸数在306~650之间,全部属于亲水性蛋白。植物的EIN3/EIL基因有广泛的共线性,且共线性区域含有多个基因。在水稻的茎、花、根和叶中都出现了EIN3/EIL基因,由表达量我们能清楚地看出Os24128240、Os24126076和Os24109079基因比其他基因的高。对花的形成及根和幼苗的发育,Sb1953535基因在高粱中有着重要的调控作用。本研究初步解析了EIN3/EIL基因家族的系统进化,有助于进一步研究基因家族成员EIN3/EIL的功能。