基于单细胞转录组测序数据分析胃癌调节性T细胞特征

摘要

目的探究胃癌及胃正常组织的细胞组成,分析调节性T细胞在胃癌及胃正常组织中的差异。方法下载胃癌单细胞转录组测序数据并进行质控、降维聚类及细胞注释,提取调节性T细胞进行差异基因、轨迹、GSVA及细胞相互作用分析,明确正常组织和肿瘤组织来源的调节性T细胞特征。结果在细胞组成方面,不同患者、不同样本类型之间存在较大异质性。与正常组织相比,调节性T细胞在肿瘤组织占比更高,与细胞死亡、细胞周期等通路相关。细胞相互作用分析显示,肿瘤组织中调节性T细胞与其他细胞相互作用频率更低、强度更大,互作模式具有显著变化。结论调节性T细胞主要在胃癌肿瘤微环境中存在。胃癌及胃正常组织中调节性T细胞在数量、功能等方面存在显著差异。