基于16S rRNA测序的肺癌不同阶段中痰液菌群差异分析

摘要

目的 初步评估不同分期肺癌患者痰液菌群分布的差异。方法 收集2019年6月—2021年8月本院肺癌早期、晚期患者及正常对照各20例,取痰液进行16S rRNA测序,分析群落丰富度指数ace和chao,以及群落多样性指数coverage、shannon及simpson,并计算相对丰度。结果 群落多样性指数shannon在各组之间差异均有统计学意义(P<0.01),群落多样性指数simpson在早期和晚期组均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.01)。放线菌门在晚期肺癌组(26.86±13.63)、早期肺癌组(10.42±4.50)及对照组(5.08±3.16)中的相对丰度差异两两之间差异均有统计学意义(P<0.01);变形菌门在早期肺癌组(22.08±30.25)中的相对丰度高于对照组(7.21±12.08),差异有统计学意义(P<0.01);互养菌门在晚期肺癌组(0.33±0.28)、早期肺癌组(0.10±0.27)和对照组(0.06±0.09)中的相对丰度差异均有统计学意义(P<0.01);蓝细菌门在晚期肺癌组(0.17±0.57)、早期肺癌组(0.01±0.04)和对照组(0.01±0.01)中的相对丰度差异有统计学意义(P<0.01)。结论 放线菌门、变形菌门、互养菌门、蓝细菌门等菌门在肺癌的发生发展中具有重要作用,可作为有潜力的肺癌早期标记物。