霍乱弧菌H2C全基因组测序及序列分析

摘要

目的 了解霍乱弧菌产毒株的基因序列,为霍乱基因组学研究提供资料,对可能发生的公共卫生突发事件提供保障。方法 利用Illumina Hiseq测序平台对1株霍乱弧菌(Vibrio cholerae)H2C进行了全基因组测序,对基因组进行组装、基因预测和功能注释。结果 H2C基因组大小为4.09 Mb,GC含量为47.34%,预测编码基因3 642个。在H2C基因组中注释到3 252个基因具有直系同源蛋白簇分类,共查到111个tRNA和9个rRNA基因。与代谢通路相关基因2 366个,与毒力相关基因417个。通过KEGG定位到RTX、CTX和TCP毒力相关基因簇。结论 霍乱弧菌H2C携带多种毒力相关基因,对该菌致病性及环境适应性起到关键作用。