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宁波口岸鼠类感染钩端螺旋体的PCR检测和基因序列分析

         

摘要

目的对宁波地区鼠类携带的钩端螺旋体进行聚合酶链反应(PCR)检测并分析基因序列特征。方法设计钩端螺旋体的sec Y基因和23S r DNA基因引物,对宁波梅山口岸2014年5月-12月捕获的鼠类样本进行PCR检测及核苷酸序列测定与系统进化分析。结果共检测72份鼠类样本,其中5份黑线姬鼠经检测为阳性,分离获得钩端螺旋体株DXLP1501,该菌株sec Y基因扩增片段大小为285 bp,23S r DNA基因扩增片段大小为484 bp。同源性比对结果显示,23S r DNA基因片段的系统发生分析显示DXLP1501与博氏螺旋体株L550位于同一分支,遗传距离为0.005;sec Y基因片段的系统发生分析显示DXLP1501与5株博氏钩端螺旋体菌株和1株梅氏钩端螺旋体位于同一分支,遗传距离为0.011。结论本研究证实了宁波地区鼠类中存在博氏钩端螺旋体的流行。

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