甘菊ClKRPs转录因子的鉴定及分子生物学分析

摘要

甘菊[Chrysanthemum lavandulifolium（Fisch.ex Trautv.） Ling et Shih]为菊科菊属植物，二倍体，基因组较小，为栽培菊花的亲本之一。KRP是植物中独特的转录因子，参与细胞周期调控，影响植物生长和发育。本试验以甘菊为材料，克隆ClKRPs基因，分析其基本理化性质、构建系统进化树、miRNA靶基因预测、保守基序分析。结果表明，ClKRPs转录因子相对分子量为29.10～144.30,ClKRPs蛋白都为酸性蛋白；ClKRP1、ClKRP2、ClKRP3、ClKRP5、ClKRP6、ClKRP10、ClKRP12、ClKRP14、ClKRP15蛋白为稳定蛋白，ClKRP4、ClKRP7、ClKRP8、ClKRP9、ClKRP11、ClKRP13、ClKRP16为不稳定蛋白。系统发育分析显示，甘菊ClKRPs蛋白可以分为两大类。利用MEME软件识别出6个甘菊ClKRP保守基序。生物信息学分析预测5个ClKRP基因与4个miRNA结合。本研究为进一步探索和分析甘菊ClKRPs转录因子的功能奠定了基础。