高粱GATA转录因子家族的鉴定和表达模式分析

摘要

GATA基因家族是真核生物中的一种转录因子，在动植物发育分化、生长增殖、分解凋亡以及植物响应环境变换等生物学过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学手段对高粱（Sorghum） GATA基因家族进行了全基因组分析，鉴定得到31个GATA基因家族成员，定位在9条染色体上（第7号染色体除外）；亚细胞定位预测表明这些基因主要位于细胞核上；系统进化分析可将高粱GATA成员分为3个亚家族，大部分相似功能的已知植物GATA成员被聚在同一分枝上；表达模式分析表明，21个高粱GATA家族成员在6个高粱组织中表达具有特异性。本研究鉴定并分析了高粱GATA转录因子的生物学信息特征，为分子水平上高粱GATA家族基因的功能研究提供了一定的理论基础。