基于转录组数据竹叶花椒WRKY基因家族的鉴定及表达分析

摘要

WRKY是一类重要的转录因子，广泛参与调控植物的生长发育和多种应激反应。本研究基于竹叶花椒不同组织（根,芽,皮刺,果）的转录组测序数据，通过BLAST比对获得WRKY基因序列，并对获得的基因进行生物信息学分析；结合竹叶花椒不同组织基因表达数据，分析参与竹叶花椒生长发育相关的WRKY转录因子。从竹叶花椒转录组共鉴定出43个WRKY转录因子，其中包括Ⅰ型基因6个、Ⅱ-a型基因4个、Ⅱ-b型基因7个、Ⅱ-c型基因13个、Ⅱ-d型基因5个、Ⅱ-e型基因4个、Ⅲ型基因4个。ZaWRKY基因表达热图分析显示，ZaWRKY38基因只在芽中表达，ZaWRKY25、ZaWRKY26、ZaWRKY22、ZaWRKY29、ZaWRKY37、ZaWRKY41基因只在根中表达，ZaWRKY15、ZaWRKY30基因只在果中表达，ZaWRKY1、ZaWRKY2、ZaWRKY10、ZaWRKY18、ZaWRKY28、ZaWRKY36、ZaWRKY43基因只在皮刺中表达，而且ZaWRKY2、ZaWRKY10、ZaWRKY28这3个基因的表达量随着皮刺发育过程出现逐渐增长的现象，表明这3个基因可能参与调节皮刺的生长发育。本研究首次鉴定竹叶花椒WRKY转录因子家族结构特征和表达特性，这将为进一步解析竹叶花椒WRKY转录因子的功能提供研究基础。