油棕TCP转录因子家族生物信息学鉴定及基因表达分析

摘要

TCP基因作为植物所特有的转录因子家族，广泛参与调控植物的生长发育、代谢、信号转导、生理生化刺激响应及逆境应答等多个生物学过程。本研究利用生物信息学研究方法鉴定获得28个油棕TCP基因家族成员，并对其染色体定位、结构特点、motif、聚类分析及组织表达特异性进行分析。结果表明：共有27个基因在油棕的14条染色体上呈不均匀分布；EgTCP基因的长度均相对较短，其中14个基因只有1个外显子，EgTCP11基因含外显子个数最多（5个）；序列分析表明油棕TCP基因均含有高度保守的bHLH结构域，启动子上存在较多的植物激素响应及逆境应答等顺式作用元件；系统进化分析显示28个油棕TCP蛋白被划分为ClassⅠ（13个蛋白）和ClassⅡ（15个蛋白）两大类，其中ClassⅡ进一步分为CYC/TB1 （4个蛋白）和CIN （11个蛋白）两个亚类；通过表达模式分析发现花中特异表达的TCP基因数量最多（EgTCP05, EgTCP09,EgTCP15, EgTCP27和EgTCP28）,EgTCP27基因在中果皮中的表达量逐渐上调，到花后23周时表达量升至最大。本研究为进一步探索油棕TCP基因的生物调控功能提供一定的理论基础。