基于EST-SSR分子标记技术的高良姜栽培类型的鉴别

摘要

高良姜（Alpinia officinarum Hance）的根茎是著名的“十大广药”之一，具有较高的药用和食用价值。本研究基于EST-SSR分子标记技术，对采自广东省徐闻县的5种高良姜栽培类型（黑鳞蜂窝姜,白鳞蜂窝姜,鸡姜,牛姜,竹头姜）及采自海南省的2种高良姜栽培类型（文昌高良姜,万宁高良姜）进行遗传多样性分析，以构建不同高良姜栽培类型的EST-SSR数字指纹图谱及鉴别体系。结果表明，对EST-SSR位点的100对引物进行筛选，得到扩增条带清晰且稳定的引物21对，占引物总数的21%。利用21对引物对7种高良姜栽培类型基因组DNA进行扩增共得到239条条带，平均每对引物的扩增条带有11.4条，其中多态性条带204条，占85.36%。对这21个多态性EST-SSR位点进行分析，其中多样性指数（I）平均值为1.06，观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、Nei基因多样性指数、多态性信息含量（PIC）的平均值均在0.5以上。其中14个EST-SSR位点的PIC值大于0.5，属于高多态性位点；5个EST-SSR位点的PIC值在0.25～0.5，属中度多态性位点。建立不同栽培类型高良姜EST-SSR数字指纹图谱及EST-SSR标记检索表，发现引物P-59可将7种高良姜栽培类型区分为6个类型，而引物P-3可将白鳞蜂窝姜与黑鳞蜂窝姜进行区分。该结果可用于7种高良姜主栽培类型的鉴别，为高良姜品种选育提供重要依据。