红花NAC基因家族鉴定及干旱胁迫响应分析

摘要

NAC（NAM/ATAF/CUC）转录因子是植物最大的转录基因家族之一，在植物应对干旱胁迫中具有重要作用。为了研究NAC基因家族在红花中的数量及功能，该文以红花的全基因组数据为基础，利用生物信息学手段对红花NAC基因家族成员进行鉴定，并分析了其理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、保守结构域及保守基序。同时，利用qRT-PCR方法分析了4个NAC基因在干旱胁迫处理不同时间后的转录水平。结果表明，红花NAC基因家族有87个成员，不均匀分布在11条染色体上，其中第12号染色体不存在NAC基因；87个NAC基因氨基酸数目为103～974个，CDS数目为3～9个；进化分析可将其分为17个亚家族；保守结构域分析大多数基因含有5个保守的亚结构域A～E;保守基序分析发现，motif2在NAC基因中最保守。表达模式分析发现干旱胁迫不同处理时间后，4个与抗旱相关的NAC基因在叶片中的转录水平均呈上调趋势，推测这4个NAC基因可能与红花抗旱性有关。该研究为红花NAC转录因子进一步功能研究奠定了理论基础，为培育耐旱性红花品种提供参考依据。