复发性流产相关基因的生物信息学分析

摘要

目的归纳复发性流产相关基因的文献,并进行生物信息学分析,为进一步的研究和临床治疗提供参考依据。方法检索CNKI、万方、Pubmed数据库从2005年1月1日—2018年5月30日发表的文献,统计出复发性流产的相关基因,并用DAVID在线数据库对基因进行基因本体论(GO)富集分析、京都基因与基因组百科(KEGG)通路分析,STRING在线数据库构建蛋白-蛋白互作网络图(PPI),Cytoscape 3.7.0软件进行可视化分析。结果筛选出674篇文献,摘录复发性流产相关基因170个,DAVID不同分类149种,KEGG通路60种,这些基因主要参与炎症反应、免疫应答、RNA聚合酶II启动子转录的正调控/负调控、血管生成、T细胞增殖等有关。KEGG通路主要是参与癌症中的蛋白聚糖、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Jak-STAT信号通路、HIF-1信号通路、炎症性肠病、内风湿关节炎等。其中129个参与构建PPI,进一步可视化分析筛选出节点度数排前10的基因:IL6、IL10、VEGFA、TGFβ1、IFNG、TP53、IL1β、STAT3、CCL2、TLR4。结论所筛选复发性流产的关键基因有助于进一步研究该病的发病机制,同时为药物防治该病提供新的靶点。