中国汉族人群MHC区域与胃癌易感性的关联

摘要

目的探讨主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)区域遗传变异与胃癌易感性的关联。方法采用病例对照研究设计,以中国汉族人群MHC参考数据集为参照,利用SNP2HLA v1.0.3软件对MHC区域进行基因型填补;应用Logistic回归分析模型鉴定MHC区域中与胃癌易感性存在关联的遗传变异;基于公共数据库,通过系统功能注释探索MHC区域内的易感基因和功能性遗传变异。结果本研究发现,rs2517714为MHC区域与胃癌发生风险独立关联的遗传位点(OR=1.13,P=2.70×10-8);功能注释显示位于HLA-A基因外显子区域的氨基酸多态性位点及单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)可能会影响HLA-A蛋白稳定性;同时,非编码区的功能性遗传变异rs9295829可能通过影响所在区域增强子活性,从而远程调控HLA-A基因表达,共同影响易感基因HLA-A的功能。结论MHC区域致病性遗传变异通过影响易感基因HLA-A功能,从而影响胃癌易感性。