活禽市场环境新型H5N6亚型禽流感病毒的鉴定及其基因特征分析

摘要

目的对活禽市场环境中的新型H5N6亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)进行测序鉴定和基因分析,为防控人感染H5N6亚型AIV提供依据。方法对活禽市场环境中检出的1份H5亚型AIV核酸阳性标本进行红细胞凝集素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因通用引物RT-PCR扩增和测序,经BLAST比对和Mega 6. 0软件构建进化树来分析病毒基因特征。结果 1份H5亚型AIV核酸阳性标本经测序鉴定为新型H5N6亚型AIV,进化分析显示该病毒HA和NA均与分离自越南的禽源H5N6亚型AIV株亲缘关系近, HA连接肽出现6个碱性氨基酸(amino acids,aa), HA受体结合区域aa为QRG,受体特征为禽源, NA蛋白第69~73位点aa出现茎缺失。结论环境中1份H5亚型AIV核酸阳性病毒鉴定为新型H5N6亚型AIV,该病毒对禽表现为高致病性的分子特征,但具有不容易感染人的受体结合特征。