BCAT1在肝癌中的表达、预后及免疫浸润的生物信息学分析

摘要

目的探讨BCAT1在肝癌中的表达及其与预后、免疫浸润的关系。方法TCGA数据库分析多种肿瘤组织中BCAT1 mRNA的表达水平;GEPIA2数据库、HPA数据、TIMER数据库和LinkedOmics数据库分别分析BCAT1 mRNA的表达水平与肝癌患者的生存状态的关系、BCAT1表达定位、BCAT1与肝癌组织中免疫细胞浸润程度的相关性及共表达基因,对共表达基因进行GO、KEGG富集分析,Cytoscape软件鉴定肝癌中与BCAT1共表达基因的Hub基因。结果BCAT1 mRNA在乳腺浸润癌、胆管癌、肝癌等均高表达(P<0.05)。BCAT1在肝癌组织细胞核呈现中等及高表达,在正常组织中呈弱表达或无表达。BCAT1 mRNA表达(高表达)是肝癌患者预后的独立危险因素(P<0.05)。BCAT1高表达的肝癌患者中位生存时间降低(P=0.001)。肝癌组织中BCAT1 mRNA表达水平与B细胞、CD4+T细胞等浸润程度成正相关性(P<0.001)。共表达基因包括APOH、CD86、SYK、AMBP、C3AR1、CYBB、MSR1、FTCD、SERPINC1和PROC。结论BCAT1可作为肝癌患者预后不良的标志物,BCAT1可能通过影响免疫细胞浸润及代谢途径调控肝癌的发生发展。