紫花报春苣苔差异表达基因分析及离子转运蛋白基因挖掘

摘要

石灰土及红壤中栽培的紫花报春苣苔的叶片生长性状及元素含量存在差异,为了从分子水平上揭示造成这种差异的原因,本研究采集在两种土壤中生长的紫花报春苣苔植株的叶片进行转录组测序,利用公共数据库注释获得的Unigene,对差异表达基因进行GO及KEGG富集分析,以挖掘离子转运蛋白基因。研究结果表明紫花报春苣苔叶片的转录组测序共得到176 491个Unigene,N50值为1 718 bp,Unigene主要以大于500 bp的片段为主,GO功能及KEGG分类显示紫花报春苣苔的叶片基因表达谱主要与细胞,细胞成分,细胞器组成,蛋白质翻译,物质的合成与代谢相关联。对656个差异表达基因进行GO、KEGG功能富集分析及基因功能注释发现,有231个差异表达基因分别被富集到了77条KEGG的Pathway中,获得了与离子转运有关的差异表达基因共18个,分属于11个类别,在红壤中主要以下调表达为主,这些基因的下调表达及基因间的相互作用可能使两种土壤中紫花报春苣苔叶片的生长性状产生差别。本研究对于从分子水平上揭示紫花报春苣苔引种实验的适应机制,以及紫花报春苣苔的引种保护和开发利用具有重要意义。