菠萝蜜响应低温胁迫的转录组分析

摘要

基于转录组研究抗寒性不同的菠萝蜜品系,筛选菠萝蜜抗寒关键基因,为菠萝蜜抗寒改良和耐寒良种选育提供参考。以自然低温胁迫后广西本地菠萝蜜抗寒品系、泰国引进的低温敏感型菠萝蜜品系为材料,结合田间表型持续观测,并运用转录组测序技术从分子水平上对2个不同抗寒特性菠萝蜜品系进行生物信息学分析。结果表明,两个品系共有差异表达基因30 585个,上调17 083个,下调13 502个。GO功能富集分析发现,差异表达基因显著富集在光合作用的光捕获、光反应、光合作用的调节,光强度反应,光系统、光系统I、光系统II,叶绿素、NADH、色素结合功能,以及类黄酮、类胡萝卜素、萜类等次生代谢物的代谢过程。KEGG途径富集分析发现,光合作用相关途径、淀粉与蔗糖代谢途径、植物激素信号转导途径及MAPK信号通路为菠萝蜜响应低温胁迫的重要代谢途径。差异表达基因注释到WRKY、ERF、bHLH、NAC、MYB等家族转录因子,与植物应答低温胁迫密切相关,可能参与菠萝蜜应答低温胁迫。