基于SSR标记的76份紫心甘薯品种的遗传多样性分析

摘要

为探明中国育成的紫心甘薯品种之间的遗传多样性和遗传差异,本研究利用124对SSR引物对搜集到的76个紫心甘薯品种进行遗传多样性分析。通过6%的聚丙烯酰胺凝胶电泳获得76个品种的PCR扩增条带数据,构建0~1数据矩阵,利用NTSYS 2.10e软件计算Nei’s遗传距离,将遗传距离系数矩阵导入MEGA 7.0.26,进行遗传距离分析和NJ聚类分析;利用Structure 2.3.4软件进行群体结构分析。结果表明:124对引物共扩增出750条条带,其中多态性条带为90.13%,每对引物检测出2~18个等位变异,平均6.05个;76个紫心甘薯品种的遗传距离在0.0442~0.6010之间,平均为0.2921,进一步分析发现,中国各薯区品种间的遗传距离较近,外引品种绫紫与中国各薯区品种间的遗传距离较远,因此可以通过引进国外紫薯品种来扩大中国紫心甘薯的遗传背景;在遗传距离0.2613处可分为3个族群,在0.2253处可分为9个族群,在0.2173处将第Ⅸ族群划分为4个亚群,来源地相近或拥有相同亲本的紫心甘薯材料有聚在一起的趋势;通过对群体结构K值分析,发现76份品种划分为3个稳定的群体,最大Q值分析发现,最大Q值越大群体的遗传背景就越简单,最大Q值<0.6时,品种的遗传成分来源于不同群体,群体间存在明显的基因交流,76个紫心甘薯品种遗传成分有3个变异来源。