基于线粒体Cytb基因的龙头鱼及其近缘物种分子系统发育研究

摘要

测定了长度为1092bp的龙头鱼(Harpadonnehereus)线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列片段,并分析探讨了龙头鱼及其近缘种分子系统发育关系。研究结果表明,4种碱基平均含量分别为29.9%(胸腺嘧啶T)、31.2%(胞嘧啶C)、22.9%(腺嘌呤A)、16%(鸟嘌呤G)。碱基替换多发生在密码子第三位点,且分布呈明显偏倚现象,约占总变异的70.1%。碱基转换数略高于颠换数,二者比值为2.03,碱基替代饱和度检验显示碱基突变率尚未达到饱和。以哲罗鱼和河鳟为外群构建邻接系统发育树分成两支,灯笼鱼科鱼类聚为一支,龙头鱼属和蛇鲻属亲缘关系较近。基于非同义突变率(Ka)和同义突变率(Ks)的选择压力分析结果表明,灯笼鱼目鱼类经历了正选择,这与其在长期进化过程中适应深海栖息环境有关,而龙头鱼属和蛇鲻属不同位点似然比率检验未检测到正选择位点,推测与这两种类群的鱼类分布的水深较浅有关。