2013年深圳市新甲型H1N1流感病毒分子变异研究

摘要

目的了解2013年深圳市新甲型H1N1流感病毒的分子变异情况。方法用MDCK细胞进行流感病毒分离,收获病毒后提取病毒RNA作为模板,利用RT-PCR对其HA基因进行扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定后测序,测序结果用Clustal W2和MEGA3.1软件进行序列分析。结果 2013年的深圳毒株与同年国内外的流行株差异不大,但与同期国际疫苗株A/California/7/2009相比,在进化树上已经产生了明显的分离,且出现了2个不同的进化分支;HA分子有多个氨基酸位点发生了变异,其中有4个变异位点位于抗原决定簇区域内:抗原决定簇Sa的135位点由N变成了S,163位点的K出现了N/Q/I的多元突变;抗原决定簇Sb的185位点由S变成了T;抗原决定簇Ca1的203位点由S变成了T,这些变异的出现会导致病毒抗原性的改变。结论 2013年深圳市流行的新H1N1病毒有较大可能会形成一个新的优势流行株。