转录组学揭示七叶一枝花在种子休眠解除相关差异基因

摘要

为了探究七叶一枝花种子休眠解除过程中差异基因的表达及相关代谢通路,本研究以七叶一枝花不同萌发阶段的种子为材料,通过新一代高通量测序技术对样品进行转录组测序及相关的生物信息学分析。差异基因GO分类分析表明,萌发过程DEGs主要富集在生物过程、细胞成分和分子功能3个方面,包括代谢过程和催化活性等途径。基于KEGG数据分析,20个萌发相关的代谢通路参与种子萌发过程,其中淀粉和糖代谢和植物激素信号转导中差异基因发生显著性变化。在种子萌发阶段,种子休眠被打破是由于β-淀粉酶基因表达发生上调,而休眠解除后,由于α-淀粉酶基因表达上调,促进了种子胚轴发育和胚根发生。此外,KEGG富集分析表明,七叶一枝花种子萌发中八大激素参与该过程,包括生长素、细胞分裂素、赤霉素、脱落酸、油菜素内酯、茉莉酸、水杨酸和乙烯。